Permet d'extraire un bilan qualité à partir du fichier CSV contenant la matrice des diagnostics.
Arguments
- matrix_output_file
Chaîne de caracère. Chemin vers le fichier CSV contenant la matrice des diagnostics.
- file
Chaîne de caracère. Chemin vers le fichier CSV contenant la matrice des diagnostics. Cet argument remplace l'argument
matrix_output_file.- sep
séparateur de caractères utilisé dans le fichier csv (par défaut
sep = ";")- dec
séparateur décimal utilisé dans le fichier csv (par défaut
dec = ",")- thresholds
listde vecteurs numériques. Seuils appliqués aux différents tests afin de classer en modalitésGood,Uncertain,BadetSevere. Par défault, la valeur de l'option"jdc_threshold"est utilisée. Vous pouvez appeler la fonctionget_thresholdspour voir à quoi doit ressemble l'objetthresholds.
Value
Un objet de type QR_matrix.
Details
La fonction permet d'extraire un bilan qualité à partir d'un fichier csv contenant l'ensemble des diagnostics (généralement fichier demetra_m.csv).
Ce fichier peut être obtenu en lançant le cruncher
(cruncher ou
cruncher_and_param) avec l'ensemble des
paramètres de base pour les paramètres à exporter et l'option
csv_layout = "vtable" (par défaut) pour le format de sortie des
fichiers csv (option de cruncher_and_param ou de
create_param_file lors de la création du fichier
de paramètres).
Le résultat de cette fonction est un objet QR_matrix qui est
une liste de trois paramètres :
le paramètre
modalitiesest undata.framecontenant un ensemble de variables sous forme catégorielle (Good, Uncertain, Bad, Severe).le paramètre
valuesest undata.framecontenant les valeurs associées aux indicateurs présents dansmodalities(i.e. : p-valeurs, statistiques, etc.) ainsi que des variables qui n'ont pas de modalité (fréquence de la série et modèle ARIMA).le paramètre
score_formulaest initié àNULL: il contiendra la formule utilisée pour calculer le score (si le calcul est fait).
Si x est fourni, les arguments fichier et
matrix_output_file sont ignorés. L'argument fichier désigne
également le chemin vers le fichier qui contient la matrice de diagnostic
(qui peut être importée en parallèle dans R et utilisée avec l'argument
x).
Examples
# Chemin menant au fichier demetra_m.csv
demetra_path <- file.path(
system.file("extdata", package = "JDCruncheR"),
"WS/ws_ipi/Output/SAProcessing-1",
"demetra_m.csv"
)
# Extraire le bilan qualité à partir du fichier demetra_m.csv
QR <- extract_QR(file = demetra_path)
#> Multiple column found for extraction of q statistic
#> First column selected
#> Multiple column found for extraction of q-m2 statistic
#> First column selected
print(QR)
#> The quality report matrix has 13 observations
#> There are 18 indicators in the modalities matrix and 20 indicators in the values matrix
#>
#> The quality report matrix contains the following variables:
#> series residuals_homoskedasticity residuals_skewness residuals_kurtosis residuals_normality residuals_independency qs_residual_sa_on_sa f_residual_sa_on_sa qs_residual_sa_on_i f_residual_sa_on_i f_residual_td_on_sa f_residual_td_on_i oos_mean oos_mse q q_m2 m7 pct_outliers frequency arima_model
#>
#> The variables exclusively found in the values matrix are:
#> frequency arima_model
#>
#> No score was calculated
# Extraire les modalités de la matrice
QR[["modalities"]]
#> series residuals_homoskedasticity residuals_skewness residuals_kurtosis
#> 1 RF0610 Uncertain Good Good
#> 2 RF0620 Good Bad Bad
#> 3 RF0811 Uncertain Bad Bad
#> 4 RF0812 Bad Good Uncertain
#> 5 RF0893 Good Good Good
#> 6 RF0899 Good Good Good
#> 7 RF1011 Good Good Good
#> 8 RF1012 Good Good Good
#> 9 RF1013 Bad Bad Bad
#> 10 RF1020 Bad Good Uncertain
#> 11 RF1031 Bad Uncertain Bad
#> 12 RF1032 Good Good Good
#> 13 RF1039 Bad Uncertain Bad
#> residuals_normality residuals_independency qs_residual_sa_on_sa
#> 1 Good Good Good
#> 2 Bad Good Good
#> 3 Bad Bad Good
#> 4 Good Bad Good
#> 5 Good Uncertain Good
#> 6 Good Bad Good
#> 7 Good Bad Severe
#> 8 Good Bad Severe
#> 9 Bad Bad Bad
#> 10 Uncertain Bad Severe
#> 11 Bad Bad Bad
#> 12 Good Bad Good
#> 13 Bad Bad Severe
#> f_residual_sa_on_sa qs_residual_sa_on_i f_residual_sa_on_i
#> 1 Good Good Good
#> 2 Good Good Good
#> 3 Good Good Good
#> 4 Good Good Good
#> 5 Good Good Good
#> 6 Good Good Good
#> 7 Good Severe Good
#> 8 Good Severe Good
#> 9 Good Bad Good
#> 10 Good Bad Good
#> 11 Good Uncertain Good
#> 12 Good Good Good
#> 13 Good Bad Good
#> f_residual_td_on_sa f_residual_td_on_i oos_mean oos_mse q q_m2 m7
#> 1 Bad Uncertain Good Bad Good Good Good
#> 2 Good Good Good Bad Good Good Good
#> 3 Severe Bad Good Uncertain Bad Bad Good
#> 4 Severe Severe Good Good Good Good Good
#> 5 Good Good Good Good Bad Bad Good
#> 6 Bad Bad Good Good Good Good Good
#> 7 Severe Severe Good Good Bad Bad Good
#> 8 Severe Severe Good Good Bad Bad Good
#> 9 Severe Severe Good Good Bad Bad Bad
#> 10 Severe Severe Good Uncertain Good Bad Good
#> 11 Uncertain Uncertain Good Bad Good Good Good
#> 12 Severe Severe Good Good Bad Bad Good
#> 13 Severe Severe Good Uncertain Good Good Good
#> pct_outliers
#> 1 Uncertain
#> 2 Bad
#> 3 Good
#> 4 Good
#> 5 Good
#> 6 Good
#> 7 Good
#> 8 Good
#> 9 Good
#> 10 Good
#> 11 Uncertain
#> 12 Good
#> 13 Good
# Or:
QR[["modalities"]]
#> series residuals_homoskedasticity residuals_skewness residuals_kurtosis
#> 1 RF0610 Uncertain Good Good
#> 2 RF0620 Good Bad Bad
#> 3 RF0811 Uncertain Bad Bad
#> 4 RF0812 Bad Good Uncertain
#> 5 RF0893 Good Good Good
#> 6 RF0899 Good Good Good
#> 7 RF1011 Good Good Good
#> 8 RF1012 Good Good Good
#> 9 RF1013 Bad Bad Bad
#> 10 RF1020 Bad Good Uncertain
#> 11 RF1031 Bad Uncertain Bad
#> 12 RF1032 Good Good Good
#> 13 RF1039 Bad Uncertain Bad
#> residuals_normality residuals_independency qs_residual_sa_on_sa
#> 1 Good Good Good
#> 2 Bad Good Good
#> 3 Bad Bad Good
#> 4 Good Bad Good
#> 5 Good Uncertain Good
#> 6 Good Bad Good
#> 7 Good Bad Severe
#> 8 Good Bad Severe
#> 9 Bad Bad Bad
#> 10 Uncertain Bad Severe
#> 11 Bad Bad Bad
#> 12 Good Bad Good
#> 13 Bad Bad Severe
#> f_residual_sa_on_sa qs_residual_sa_on_i f_residual_sa_on_i
#> 1 Good Good Good
#> 2 Good Good Good
#> 3 Good Good Good
#> 4 Good Good Good
#> 5 Good Good Good
#> 6 Good Good Good
#> 7 Good Severe Good
#> 8 Good Severe Good
#> 9 Good Bad Good
#> 10 Good Bad Good
#> 11 Good Uncertain Good
#> 12 Good Good Good
#> 13 Good Bad Good
#> f_residual_td_on_sa f_residual_td_on_i oos_mean oos_mse q q_m2 m7
#> 1 Bad Uncertain Good Bad Good Good Good
#> 2 Good Good Good Bad Good Good Good
#> 3 Severe Bad Good Uncertain Bad Bad Good
#> 4 Severe Severe Good Good Good Good Good
#> 5 Good Good Good Good Bad Bad Good
#> 6 Bad Bad Good Good Good Good Good
#> 7 Severe Severe Good Good Bad Bad Good
#> 8 Severe Severe Good Good Bad Bad Good
#> 9 Severe Severe Good Good Bad Bad Bad
#> 10 Severe Severe Good Uncertain Good Bad Good
#> 11 Uncertain Uncertain Good Bad Good Good Good
#> 12 Severe Severe Good Good Bad Bad Good
#> 13 Severe Severe Good Uncertain Good Good Good
#> pct_outliers
#> 1 Uncertain
#> 2 Bad
#> 3 Good
#> 4 Good
#> 5 Good
#> 6 Good
#> 7 Good
#> 8 Good
#> 9 Good
#> 10 Good
#> 11 Uncertain
#> 12 Good
#> 13 Good